|
Center for Biologisk Sekvensanalyse
ved Institut for Bioteknologi tilbyder et nyt kursus i bioinformatik.
Computerbaserede
metoder spiller allerede nu en afgørende rolle indenfor mikrobiologien,
bioteknologien og lægemiddelforskningen. Store internationale sekvens- og
strukturdatabaser indeholder information som i mange tilfælde helt kan
erstatte eksperimentelt arbejde, og i andre tilfælde bruges til at
få langt mere ud af de eksperimentelle ressourcer.
Kursets mål er således at give de studerende kendskab til en række nye
metoder til molekylær struktur- og sekvensanalyse.
Undervisningsform: Forelæsninger.
Praktiske øvelser i slutningen af kurset. Kurset afsluttes med en
rapport, der bliver bedømt efter 13-skalaen.
Faglige forudsætninger:
Lineær algebra (01014) og Biologisk kemi (24001, tidligere 24201), eller
tilsvarende.
Kursusindhold: Bioinformatik
i genomæraen, hvor de komplette arveanlæg for mange bakterier,
svampe og dyr er kendt.
Sammenligning af nukleotid- og aminosyresekvenser: parvis alignment, multiple alignments, phylogeni,
databasesøgning. Struktur- og funktionsforudsigelse med neurale netværk
og skjulte Markov modeller. Genfinding i sekvenser fra genomprojekter.
Proteinstruktur
og funktion. HIV phylogeni. Praktiske øvelser med alignment og neural
netværksforudsigelse.
Undervisningen finder sted to gange om ugen
fra den 31. august
til og med den 10. december 1999. For mere udførlige oplysninger se
Kursus
Program eller Studiehåndbog 1999/2000.
Point: 5 point (et studentersårsværk
er 60 point)
Yderligere oplysninger hos:
Steen Knudsen, forskningslektor, tlf.
45 25 24 80, email: steen@cbs.dtu.dk
Johanne Keiding, centeradministrator,
tlf. 45 25 24 77,
email: johanne@cbs.dtu.dk
|
