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2014 (3) 2013 (3) 2012 (1) 2011 (1) 2010 (1) 2005 (1)

2014

    Identification and assembly of genomes and genetic elements in complex metagenomic samples without using reference genomes.
    Nielsen HB, Almeida M, Juncker AS, Rasmussen S, Li J, Sunagawa S, Plichta DR, Gautier L, Pedersen AG, Le Chatelier E, Pelletier E, Bonde I, Nielsen T, Manichanh C, Arumugam M, Batto JM, Quintanilha Dos Santos MB, Blom N, Borruel N, Burgdorf KS, Boumezbeur F, Casellas F, Doré J, Dworzynski P, Guarner F, Hansen T, Hildebrand F, Kaas RS, Kennedy S, Kristiansen K, Kultima JR, Léonard P, Levenez F, Lund O, Moumen B, Le Paslier D, Pons N, Pedersen O, Prifti E, Qin J, Raes J, Sørensen S, Tap J, Tims S, Ussery DW, Yamada T; MetaHIT Consortium, Renault P, Sicheritz-Ponten T, Bork P, Wang J, Brunak S, Ehrlich SD Nat Biotechnol
    Nature Biotechnology. 2014 Jul 6., 2014
    PubMed
    Choice of bacterial DNA extraction method from fecal material influences community structure as evaluated by metagenomic analysis.
    Wesolowska A, Bahl MI, Carvalho V, Kristiansen K, Sicheritz-Pontén T, Gupta R, Licht TR
    Microbiome. 2014 Jun 5;2:19, 2014
    PubMed
    Identification of odorant-receptor interactions by global mapping of the human odorome.
    Audouze K, Tromelin A, Le Bon AM, Belloir C, Petersen RK, Kristiansen K, Brunak S, Taboureau O
    PLoS One. 2014 Apr 2;9(4):e93037., 2014
    PubMed

2013

    Whole-Exome Sequencing of 2,000 Danish Individuals and the Role of Rare Coding Variants in Type 2 Diabetes
    Lohmueller KE, Sparsø T, Li Q, Andersson E, Korneliussen T, Albrechtsen A, Banasik K, Grarup N, Hallgrimsdottir I, Kiil K, Kilpeläinen TO, Krarup NT, Pers TH, Sanchez G, Hu Y, DeGiorgio M, Jørgensen T, Sandbæk A, Lauritzen T, Brunak S, Kristiansen K, Li Y, Hansen T, Wang J, Nielsen R, Pedersen O
    AJHG, The American Journal of Human Genetics - Cell 2013, 2013
    AJHG
    Richness of human gut microbiome correlates with metabolic markers.
    Le Chatelier E, Nielsen T, Qin J, Prifti E, Hildebrand F, Falony G, Almeida M, Arumugam M, Batto JM, Kennedy S, Leonard P, Li J, Burgdorf K, Grarup N, Jørgensen T, Brandslund I, Nielsen HB, Juncker AS, Bertalan M, Levenez F, Pons N, Rasmussen S, Sunagawa S, Tap J, Tims S, Zoetendal EG, Brunak S, Clément K, Doré J, Kleerebezem M, Kristiansen K, Renault P, Sicheritz-Ponten T, de Vos WM, Zucker JD, Raes J, Hansen T; MetaHIT consortium, Bork P, Wang J, Ehrlich SD, Pedersen O, Guedon E, Delorme C, Layec S, Khaci G, van de Guchte M, Vandemeulebrouck G, Jamet A, Dervyn R, Sanchez N, Maguin E, Haimet F, Winogradski Y, Cultrone A, Leclerc M, Juste C, Blottière H, Pelletier E, LePaslier D, Artiguenave F, Bruls T, Weissenbach J, Turner K, Parkhill J, Antolin M, Manichanh C, Casellas F, Boruel N, Varela E, Torrejon A, Guarner F, Denariaz G, Derrien M, van Hylckama Vlieg JE, Veiga P, Oozeer R, Knol J, Rescigno M, Brechot C, M\\\'Rini C, Mérieux A, Yamada T
    Nature 500(7464):541-6 doi:10.1038/nature12506, 2013
    PubMed
    Discovery of a Novel Selective PPAR Ligand with Partial Agonist Binding Properties by Integrated in Silico in Vitro Work Flow
    Kouskoumvekaki I, Petersen RK, Fratev F, Taboureau O, Nielsen TE, Oprea TI, Sonne S, Flindt E, Jónsdóttir SO, Kristiansen K
    Journal of Chemical Information and Modeling 53(4):923-37 doi:10.1021/ci3006148, 2013
    PubMed

2012

    A comparative analysis of the intestinal metagenomes present in guinea pigs
    Hildebrand F, Ebersbach T, Nielsen HB, Li X, Sonne SB, Bertalan M, Dimitrov P, Madsen L, Qin J, Wang J, Raes J, Kristiansen K, Licht TR
    BMC Genomics 13:514 doi:10.1186/1471-2164-13-514, 2012
    PubMed

2011

    An Aboriginal Australian Genome Reveals Separate Human Dispersals into Asia
    Rasmussen M, Guo X, Wang Y, Lohmueller KE, Rasmussen S, Albrechtsen A, Skotte L, Lindgren S, Metspalu M, Jombart T, Kivisild T, Zhai W, Eriksson A, Manica A, Orlando L, De La Vega F, Tridico S, Metspalu E, Nielsen K, Ávila-Arcos MA, Moreno-Mayar JV, Muller C, Dortch J, Gilbert MTP, Lund O, Wesolowska A, Karmin M, Weinert LA, Wang B, Li J, Tai S, Xiao F, Hanihara T, van Driem G, Jha AR, Ricaut FX, de Knijf P, Migliano AB, Gallego-Romero I, Kristiansen K, Lambert DM, Brunak S, Forster P, Brinkmann B, Nehlich O, Bunce M, Richards M, Gupta R, Bustamante CD, Krogh A, Foley RA, Lahr MM, Balloux F, Sichertitz-Pontén T, Villems R, Nielsen R, Jun W, Willerslev E
    Science 334(6052):94-8 doi:10.1126/science.1211177, 2011
    PubMed

2010

    Pharmacophore-driven identification of PPARã agonists from natural sources
    Petersen RK, Christensen KB, Assimopoulou AN, Fretté X, Papageorgiou VP, Kristiansen K, Kouskoumvekaki I
    J. Comput. Aided Mol. Des. 25(2):107-16 doi:10.1007/s10822-010-9398-5, 2010
    PubMed

2005

    The 3\' region of human papillomavirus type 16 early mRNAs decrease expression
    Vinther J, Rosenstierne MW, Kristiansen K, Norrild B
    BMC Infect. Dis. 5:83, 2005
    PubMed

2014 (3) 2013 (3) 2012 (1) 2011 (1) 2010 (1) 2005 (1)