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2014

    An international effort towards developing standards for best practices in analysis, interpretation and reporting of clinical genome sequencing results in the CLARITY Challenge.
    Brownstein CA, Beggs AH, Homer N, Merriman B, Yu TW, Flannery KC, Dechene ET, Towne MC, Savage SK, Price EN, Holm IA, Luquette LJ, Lyon E, Majzoub J, Neupert P, McCallie D Jr, Szolovits P, Willard HF, Mendelsohn NJ, Temme R, Finkel RS, Yum SW, Medne L, Sunyaev SR, Adzhubey I, Cassa CA, de Bakker PI, Duzkale H, Dworzy Ski P, Fairbrother W, Francioli L, Funke BH, Giovanni MA, Handsaker RE, Lage K, Lebo MS, Lek M, Leshchiner I, Macarthur DG, McLaughlin HM, Murray MF, Pers TH, Polak PP, Raychaudhuri S, Rehm HL, Soemedi R, Stitziel NO, Vestecka S, Supper J, Gugenmus C, Klocke B, Hahn A, Schubach M, Menzel M, Biskup S, Freisinger P, Deng M, Braun M, Perner S, Smith RJ, Andorf JL, Huang J, Ryckman K, Sheffield VC, Stone EM, Bair T, Black-Ziegelbein EA, Braun TA, Darbro B, Deluca AP, Kolbe DL, Scheetz TE, Shearer AE, Sompallae R, Wang K, Bassuk AG, Edens E, Mathews K, Moore SA, Shchelochkov OA, Trapane P, Bossler A, Campbell CA, Heusel JW, Kwitek A, Maga T, Panzer K, Wassink T, Van Daele D, Azaiez H, Booth K, Meyer N, Segal MM, Williams MS, Tromp G, White P, Corsmeier D, Fitzgerald-Butt S, Herman G, Lamb-Thrush D, McBride KL, Newsom D, Pierson CR, Rakowsky AT, Maver A, Lovre IL, Palanda IA, Peterlin B, Torkamani A, Wedell A, Huss M, Alexeyenko A, Lindvall JM, Magnusson M, Nilsson D, Stranneheim H, Taylan F, Gilissen C, Hoischen A, van Bon B, Yntema H, Nelen M, Zhang W, Sager J, Zhang L, Blair K, Kural D, Cariaso M, Lennon GG, Javed A, Agrawal S, Ng PC, Sandhu KS, Krishna S, Veeramachaneni V, Isakov O, Halperin E, Friedman E, Shomron N, Glusman G, Roach JC, Caballero J, Cox HC, Mauldin D, Ament SA, Rowen L, Richards DR, Lucas FA, Gonzalez-Garay ML, Caskey CT, Bai Y, Huang Y, Fang F, Zhang Y, Wang Z, Barrera J, Garcia-Lobo JM, González-Lamuño D, Llorca J, Rodriguez MC, Varela I, Reese MG, De La Vega FM, Kiruluta E, Cargill M, Hart RK, Sorenson JM, Lyon GJ, Stevenson DA, Bray BE, Moore BM, Eilbeck K, Yandell M, Zhao H, Hou L, Chen X, Yan X, Chen M, Li C, Yang C, Gunel M, Li
    Genome Biology. 2014 Mar 25;15(3):R53, 2014
    PubMed

2011

    The strength of intron donor splice sites in human genes displays a bell-shaped pattern
    Wang K, Wernersson R, Brunak S
    Bioinformatics. 2011 Nov 15;27(22):3079-84. Epub 2011 Oct 12., 2011
    Relevant URL

2009

    Systems biology analysis of pre-mRNA splicing and alternative splicing, and its role in cancers
    Wang K
    Ph.D.thesis, 2009
    Analysis and prediction of gene splice sites in four Aspergillus genomes
    Wang K, Ussery DW, Brunak S
    Fungal Genet. Biol.:S14-8 doi:10.1016/j.fgb.2008.09.010, 2009
    PubMed

2008

    Alternative splicing in colon, bladder, and prostate cancer identified by exon-array analysis
    Thorsen K, Sørensen KD, Brems-Eskildsen AS, Modin C, Gaustadnes M, Hein AMK, Kruhøffer M, Laurberg S, Borre M, Wang K, Brunak S, Krainer AR, Tørring N, Dyrskjøt L, Andersen CL, Ørntoft TF
    Mol. Cell Proteomics 7(7):1214-24 doi:10.1074/mcp.M700590-MCP200, 2008
    PubMed

2007

    The implications of alternative splicing in the ENCODE protein complement
    Tress ML, Martelli PL, Frankish A, Reeves GA, Wesselink JJ, Yeats C, Olason PI, Albrecht M, Hegyi H, Giorgetti A, Raimondo D, Lagarde J, Laskowski RA, Lopez G, Sadowski MI, Watson JD, Fariselli P, Rossi I, Nagy A, Wang K, Storling Z, Orsini M, Assenov Y, Blankenburg H, Huthmacher C, Ramirez F, Schlicker A, Denoued F, Jones P, Kerrien S, Orchard S, Antonarakis SE, Reymond A, Birney E, Brunak S, Casadio R, Guigo R, Harrow J, Hermjakob H, Jones DT, Lengauer T, Orengo CA, Patthy L, Thornton JM, Tramontano A, Valencia A
    Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104(13):5495-500, 2007
    PubMed

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